*[[解剖学的3次元可視化 part1(3D Slicer)]] [#w239a445]

[[3D Slicer:http://www.slicer.org/]]を使用して、解剖学のモデルを3次元で可視化します。

以下の内容は、チュートリアル[[3DDataLoadingandVisualization_Slicer4.5_SoniaPujol:https://www.slicer.org/w/images/5/51/3DDataLoadingandVisualization_Slicer4.5_SoniaPujol.pdf]]を参照しています。
以下の内容は、Sonia Pujolさん作成のチュートリアル[[3DDataLoadingandVisualization_Slicer4.5_SoniaPujol:https://www.slicer.org/w/images/5/51/3DDataLoadingandVisualization_Slicer4.5_SoniaPujol.pdf]]を参照しています。

使用するデータは以下にありますので、ダウンロードしてください。

[[3DVisualizationData.zip:https://www.slicer.org/w/images/f/f4/3DVisualizationData.zip]]

**構成の説明 [#g7fb92f4]

3D Slicerを起動すると以下のように「Welcome to Slicer」モジュールが表示されます。

#ref(Welcom_to_Slicer_module.png,center,nowrap,50%,Welcom to Slicer module);

各モジュールの情報や設定などは、タブの中にあります。各タブをクリックすると、その内容が表示されます。

#ref(tab_for_contents.png,center,nowrap,50%,tabs for contents);

「The Main Window」タブには、Slicerのユーザーインターフェースの基本構造の情報があります。スクロールすることで、全ての内容を参照できます。

#ref(main_window_tab.png,center,nowrap,50%,Main Window tab);

以下は、3D Slicerのユーザーインタフェースです。

#ref(user_interface.png,center,nowrap,50%,User interface);

**データの読み込み [#z4e402bd]

ダウンロードした"MR-head.nrrd"ファイルを、Slicer上にドラッグ&ドロップすると、「Add data into the scene」ダイアログが立ち上がりますので、「OK」します。

#ref(drag_and_drop.png,center,nowrap,50%,drag and drop);

データが読み込まれると、"axial(横断面)", "sagittal(矢状面)", "coronal(冠状面)"の2次元ビューアに表示されます。
#ref(2d_viewers.png,center,nowrap,50%,2d viewers);

Slicerレイアウト・アイコンをクリックします。

#ref(layout_icon.png,center,nowrap,50%,layout icon);

"Red Slice only"を選択します。

#ref(red_slice_only.png,center,nowrap,50%,Red slice only);

マウスを断面ビューア―のツールバーにあるピンアイコン上に移動します。

#ref(pin_icon.png,center,nowrap,50%,Red pin icon);

”<<“ボタンをクリックするとメニューが現れます。

#ref(view_menu.png,center,nowrap,50%,view menu);

"Lightbox"メニューから"6x6 view"を選択します。(注意が出ますが"continue"してそのまま進みます)

#ref(6x6_view.png,center,nowrap,50%,6x6 view);

36枚の連続断面が表示されます。スライダーを移動すると、断面位置を変えることができます。

#ref(6x6_sections.png,center,nowrap,50%,6x6 sections);

Slicerレイアウト・アイコンから"Conventional"を選択します。

#ref(conventional.png,center,nowrap,50%,conventional view);

再び、Redビューアーのピン・アイコンから、Lightboxメニューの"1x1 view"を選択し、元に戻します。

#ref(return_1x1.png,center,nowrap,50%,bactk to 1x1 view);

Redビューアーのピン・アイコンにあるリンク・アイコンをクリックし、3つのビューアーを同期します。

#ref(link_icon.png,center,nowrap,50%,link icon);

3画面をリンクした状態で目アイコンをクリックすると、3Dビューアーに3断面がすべて表示されます。

#ref(eye_icon.png,center,nowrap,50%,eye icon);

 
#ref(3d_viewer_with_sections.png,center,nowrap,50%,3d viewer with 3 sections);

3Dビューアー上で、マウスの左ボタンを使用するとカメラの回転、右ボタンで拡大・縮小、中ボタンで平行移動できます。

#ref(mouse_operations.png,center,nowrap,50%,mouse operations);

**シーンを閉じる [#x985d293]

シーンを終了するには
  File > Close Scene
をクリックします。

#ref(close_scene.png,center,nowrap,50%,close scene);

**Slicerの終了 [#we357c93]

Sicerを終了させるには
  File > Exit
をクリックします。

#ref(exit_slicer.png,center,nowrap,50%,exit slicer);

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