解剖学的3次元可視化 part1(3D Slicer)

解剖学的3次元可視化 part1(3D Slicer) †

3D Slicerを使用して、解剖学のモデルを3次元で可視化します。

以下の内容は、Sonia Pujolさん作成のチュートリアル3DDataLoadingandVisualization_Slicer4.5_SoniaPujolを参照しています。

使用するデータは以下にありますので、ダウンロードしてください。

3DVisualizationData.zip

構成の説明 †

3D Slicerを起動すると以下のように「Welcome to Slicer」モジュールが表示されます。

各モジュールの情報や設定などは、タブの中にあります。各タブをクリックすると、その内容が表示されます。

「The Main Window」タブには、Slicerのユーザーインターフェースの基本構造の情報があります。スクロールすることで、全ての内容を参照できます。

以下は、3D Slicerのユーザーインタフェースです。

データの読み込み †

ダウンロードした"MR-head.nrrd"ファイルを、Slicer上にドラッグ&ドロップすると、「Add data into the scene」ダイアログが立ち上がりますので、「OK」します。

データが読み込まれると、"axial(横断面)", "sagittal(矢状面)", "coronal(冠状面)"の2次元ビューアに表示されます。

Slicerレイアウト・アイコンをクリックします。

"Red Slice only"を選択します。

マウスを断面ビューア―のツールバーにあるピンアイコン上に移動します。

”<<“ボタンをクリックするとメニューが現れます。

"Lightbox"メニューから"6x6 view"を選択します。（注意が出ますが"continue"してそのまま進みます）

36枚の連続断面が表示されます。スライダーを移動すると、断面位置を変えることができます。

Slicerレイアウト・アイコンから"Conventional"を選択します。

再び、Redビューアーのピン・アイコンから、Lightboxメニューの"1x1 view"を選択し、元に戻します。

Redビューアーのピン・アイコンにあるリンク・アイコンをクリックし、3つのビューアーを同期します。

3画面をリンクした状態で目アイコンをクリックすると、3Dビューアーに３断面がすべて表示されます。

3Dビューアー上で、マウスの左ボタンを使用するとカメラの回転、右ボタンで拡大・縮小、中ボタンで平行移動できます。

シーンを閉じる †

シーンを終了するには

 File > Close Scene

をクリックします。

Slicerの終了 †

Sicerを終了させるには

 File > Exit

をクリックします。