解剖学的3次元可視化 part2(3D Slicer)

解剖学的3次元可視化 part2(3D Slicer) †

3D Slicerを使用して、解剖学のモデルを3次元で可視化します。

以下の内容は、Sonia Pujolさん作成のチュートリアル3DDataLoadingandVisualization_Slicer4.5_SoniaPujolを参照しています。

使用するデータは以下にありますので、ダウンロードしてください。

3DVisualizationData.zip

シーンファイルの読み込み †

ダウンロードしたデータから"3DHeadScene.mrml"ファイルを、Sicerにドラッグ＆ドロップします。

"Add data into the scene"ダイアログが立ち上がりますので、「OK」します。

頭部の3次元表面モデルと2次元解剖断面がSlicerのビューアーに表示されます。

Modelsモジュール †

Modulesメニューから"Models"を選択します。

Modelsパネルに3次元シーンのリストが表示されます。

3次元可視化 †

"axial"断面にあるピン・アイコンにカーソルを移動し、展開されたメニュー内にある目アイコンをクリックします。

すると、頭部の3次元モデルにaxial断面が出現します。

次に、3次元シーンのリストから"Skin"を選択します。

"Display"タブを展開し、スクロールして"Color"タブを探します。

"Color"タブ内の"Opacity"を0.3に設定すると、skin形状が透過されます。

上にスクロールし、"skull_bone"を選択します。

頭蓋骨を非表示にするために、"Visible"のチェックを外します。

カーソルを"Coronal"断面ビューのピン・アイコンに移動し、目アイコンを有効にします。

"Coronal"断面が3次元ビューア―に表示されます。

Hemispheric_white_matterを選択後、"Visibility"タブの"Clip"を「On」にします。

下にスクロールし、"Clipping"タブを見つけます。

"Green Slice Clipping"を「On」であり、"Negative"が選択されていることを確かめます。

3次元ビューア―に視神経交叉が確認できます。

上にスクロールし、"Clip"を「Off」にし、"Opacity"を0.3に設定します。

こうすると、白質と2次元断面との交差を確認することができます。

coronal断面のピン・アイコンにカーソルを移動し、目アイコンを「Off」にします。

Slicerレイアウト・アイコンを"Conventional"にします。

3次元ビューア―上のピン・アイコンにカーソルを移動し、 3Dコントロール・ウィンドウを表示し、"A (anterior) view"をクリックします。

シーンの保存 †

シーンを保存するには

 File > Save

をクリックします。

"Save Scene and Unsaved Data"ウィンドウにシーンのリストが表示されます。

"File Name"のチェック外すと、全てのチェックが外れます。次に、"3DHeadScene.mrml"にチェックを入れます。

"3DHeadScene.mrml"をダブルクリックすると、名称が変更できますので

　"myNewScene.mrml"

に変更し、「Save」ボタンを押しと、シーンが保存されます。

最後に、

 File > Exit

からmyNewScene.mrmlを閉じ、Slicerを終了します。