円筒型のセグメンテーションの変更点

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*[[円筒型のセグメンテーション]] [#of0805e3]

[[3D Slicer:https://www.slicer.org/]]のセグメンテーションにおいて、画像を貫く円筒型のセグメンテーションを作成したい場合があります。

以下では、その方法を説明します。

** Segment Editorを開く [#re9d93ec]

セグメンテーションを行うためには、画像データ(Volume)を読み込んだ後に、''Segment Editor''を開きます。

''Segment Editor''は、下図のアイコン①をクリックします。

#ref(open_segment_editor.png,center,nowrap,70%, Segment Editorを開く);

** 上面と下面に円セグメント作成 [#t33f2582]

まず、円筒のセグメントとなるセグメント・グループを''Add''します。

#ref(add_button.png,center,nowrap,70%, addボタンをクリック);

次に、''Effects''において、''Paint''①を選択します。

円筒の上面・下面は、ビューアのR, G, Yで決めます。（ここでは、Rビューアを使用しています）

ビューアのつまみ②を右に移動し、画像の上面に移動します。

#ref(select_paint.png,center,nowrap,70%, Paintエフェクト);

''Paint''は円形のブラシです。（球面でマスクしたい場合は、''Sphere brush''にチェックを入れますが、円形にしたいのでチェックを入れないでください）

円の半径は、ビューア上にカーソルを移動してから、"Shitキー"＋"マウスホイール"か"Shiftキー"＋"+/-キー"を使うと変更し易いです。

円の中心はカーソルの位置となりますので、''Data Probe''で確認して、書き留めておきます。ここでは、(50, 50)としています。

左クリックすると決定され、セグメントで指定された色でマスクされます。

#ref(upper.png,center,nowrap,70%, 上面の円セグメント);

続けて、下面に移動して、同じ中心、同じ半径の円でセグメントします。

#ref(bottom.png,center,nowrap,70%, 底面の円セグメント);

** 円筒セグメント作成 [#o317b6bc]

最後に、既に作成した上面と下面の円セグメントから、円筒セグメントを作成します。

このためには、''Effects''で''Fill between slices''①をクリックします。

それから、''Initialize''②してから、''Apply''します。

#ref(Fill_Between_Slices.png,center,nowrap,70%, Fill_Between_Slices);

　　

#ref(apply_fill.png,center,nowrap,70%, Fillの適用);

以上の操作により、円筒型にマスキングできました。

円筒型のセグメンテーション の変更点

円筒型のセグメンテーションの変更点